Après des études à Nantes, Paris VIII et Genève, Jean-François Héron fonde la Chorale universitaire de Nantes en 1963, dont le répertoire comprend des œuvres a capella ou avec orchestre, et qui participe aux représentations d’opéra. En 1982, il crée l’Atelier vocal et instrumental de Grenoble, avec lequel il donne de nombreuses œuvres de l’époque baroque. De 2006 à 2016, il dirige l’ensemble vocal Pertuis Luberon, avec un répertoire célébrant Händel (Le Messie), Vivaldi, Schubert, Mozart, Liszt ou Mendelssohn.
En 2010, il rejoint l’Orchestre des Alpes du Sud (OPUS), qu’il dirige dans des concertos (Brahms, Haydn, Mozart, Vivaldi…), des suites (Bach, Tchaïkovski, Bizet, Rameau…) ou des symphonies (Schubert, Mozart, Beethoven, Britten), quand ce ne sont pas des airs d’opéra, des danses ou des ouvertures de la famille Strauss.
Avec l’International Youth Symphony Orchestra & Chorus de Blue Lake (Michigan), il donne le Requiem de Verdi et le Stabat Mater de Dvořák.
En 2012, il est nommé directeur musical de l’ensemble B. A. Bach de Montpellier.
Il a fondé en 1998 le Festival Durance Luberon, dont il a été vice-président et conseiller artistique.